电子制造业MES系统的应用中，最具关键性和技术性的两个方面就是通过系统实现智能化的现场数据采集和协调的生产调度，这也是电子制造业MES系统实现信息化、智能化生产制造执行管理目标的最重要的一步。
为了实现上述管理目标，在功能设计上，电子制造业MES系统的应用主要包括以下几大功能模块：生产计划管理、制造排程、信息采集、质量管理、生产运行调度管理、设备管理、库存管理、人力资源管理、安全管理、成本管理等。
对于最重要的两个方面——生产数据采集和生产调度，在生产数据采集上，MES系统的应用采集统计电子产品生产执行的实时数据，以及各类生产设备的运行数据。在数据采集和设备运行数据集成，系统为了实现便捷的数据分析与调用，为电子产品制造企业建立一套统一的数据管理体系，通过编码的方式实现规范的电子生产信息采集，并在生成异常提醒预警、质量信息报告、生产监控、生产信息报表等，此外MES系统还通过与其信息系统的集成实现更为详细的生产信息集成与生产管控。
在电子产品的生产调度管理上，MES系统的应用主要是通过系统的实施监控、跟踪功能，以及实时生产数据统计和分析功能，预测电子调配生产流程中可能会发生的问题和异常情况，并及时提醒预警，以便生产车间管理员能够根据当前的生产资源和环境条件，进行资源与生产进行的调配与控制，从而及时解决瓶颈问题，保证电子产品生产的顺畅进行，按订单要要求按时提交货物，提升电子制造企业的信誉度，通过提升客户满意度来提升电子制造企业的市场竞争力。
电子生产制造过程中，MES系统的生产管理也包括两大快，一个生产管理的科研生产处，主要是对进行生产计划制定和生产流程进行全程监控与管理，系统管理的另一个重点是生产车间，主要包括机械加工车间、工艺室、电子装联车间、质检中心等，系统会根据生产车间的资源状况，制定生产计划、工艺路线、工序、质量标准、生产期限等，保证在MES系统的管理与控制下电子产品生产按量、按质、按时完成。
在各个生产单位中，电子制造业MES系统的应用模式，在产品研发部门中，主要用于产品的功能、性能、规格、样式的调研与设计。车间计划，主要根据生产数据、任务，制定生产工艺，实现生产工时、生产材料的计划，并将这些信息存储在系统中，下达生产执行层。生产部门中，主要是对现场生产数据进行缉拿空与查询，以便生产那调度，完成生产任务。工艺部门，对系统的应用是，辅助电子产品生产工艺辅助系统，进行工艺流程设计。此外，还有机械加工车间、电子装联车间、质检部门等的相关应用，都是根据生产标准，或者与CAPP，或者运用条码技术，将相关信息传输至MES系统中，以进行全面系统的管理。
电子制造业MES系统的应用效益：
电子制造企业，通过么MES系统的应用，实现了生产管理透明化、严密的生产监控跟踪、细致的生产信息采集、高度的信息集成和信息共享，通过生产信息采集分析，实现协调的生产跳读为电子制造企业，大幅度提高生产效率。
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