车间成本管理是制造企业生产管理的重要内容，同时也是MES系统生产管理管理效益的重要评价方法，物料需求计划MRP是最初的生产管理技术，通过物料清单管控，可以对物料需求成本管理提供支撑，发展到现在MES系统已经比较完善了。基于MRP和MES的车间成本管理思想，可以归纳为几个方面：
MRP的成本控制强调事前计划、事中控制、事后分析相结合，进行全面成本计划与控制；但由于实际生产的复杂性，导致成本分析的误差较大，不能为企业的正常运行提供有力的支持，那么如何解决这一问题呢？需要根据实际的生产情况，获得可靠的成本数据，这就需要生产底层的支持，通过MES系统提供物料、设备、人力、工时等有关的基础数据为成本核算提供基础。
虽然MRP可以通过生产层获得必要的成本数据，但由于生产条件的不断变化，生产产品的直接人工费、直接材料费和制造费等费用也相应发生变化，所以实际成本数据是动态变化的，但由于MRP系统对车间底层的控制能力较差，生产底层的数据并不能实时反馈到上层的管理系统，在时间上存在延迟，造成产品的各项成本的不准确，对整个企业的生产管理起不到应有的辅助作用，不能及时的监督、控制车间成本的发生。
MES系统主要负责收集底层控制系统的与生产相关的实时数据，安排短期的生产作业的计划调度、监控、资源调配和生产过程的优化工作。但由于MES并不包括成本管理，所以不能将生产中的物流和资金流紧密结合起来，它只考虑了在产品生产中的优化，并没有考虑到资金的优化，而在讲求经济效益的今天，不考虑资金运用的系统可以说不是一个适用的好系统。将成本管理加入到MES系统中可以弥补上述的不足，做到生产成本的实时控制，为企业的成本核算及时、准确提供数据。
通过将成本管理和MES系统相结合，可以由生产活动直接产生财务数据，把实物形态的物料流动直接转换为价值形态的资金流动，将生产所需物料的当前位置、数量、状态和价值进行统一管理，实现了物流与资金流的集成和统一，保证了生产和财务数据一致。财务部门能及时得到资金信息应用于成本控制，通过资金流动状况反映物流和生产经营情况，随时分析企业的经济效益，参与决策，指导和控制生产经营活动。
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