在屠宰加工环节，畜牧生产管理系统的加工链信息管理复杂，屠宰车间环境差，对设备各方面性能有较高的要求。屠宰加工流程为： 入场、检疫、去头、剥皮、辟半、分割、加工、包装、冷库预冷、运输。牲畜由完整的个体分解为许多部分，最关键的问题为如何跟踪标识信息并与胴体形成一个信息链路。基于 RFID 畜牧生产管理系统的屠宰加工管理系统能建立起一套完整的信息链并实现跟踪与追溯，解决了这一难题。其工作流程图如下图所示。其中，将各个过程涉及质量安全方面的信息及时上传数据中心是关键。
畜牧生产管理系统的运销批发管理系统主要应用在途货物的监控、跟踪以及道口检查。基于 RFID 技术，在途检查环节设置电子标签“查验门”或手持阅读设备，快速扫描获取食品基本信息，加快通关效率，大大减少了食品包装破损的可能性。在配送环节，贴有 RFID 电子标签的包装箱运送到指定的零售点，在交接货物时，不需要装卸货物，读写器可以快速识别读取包装箱或托盘上的 RFID 电子标签信息，可快速获知交易过程的各个产品的来源地、交易时间、检测检疫信息，加强牲畜产品交易过程的规范性和可追溯性，同时大大加快肉类批发的交易结算速度。在批发市场，畜牧生产管理系统的运销批发管理系统能够详细记录流入和流出批发市场的带有 RFID 表示的畜类产品的储存、交易动态信息，使相关监管部门在追溯危害性食用农产品来源、去向信息时能提供充足的追溯线索。
畜牧生产管理系统的销售管理系统需要提供销售食品信息查询。另外，畜牧生产管理系统的销售管理系统功能体现在食品有效期监控和食品防盗方面。RFID 技术的特点使食品源头及供应链信息完全透明，为每个包装产品提供了唯一的身份识别和历史记录。
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