ERP系统是资源规划系统，而电子商务中存在各种类型的资源需要规划，ERP必然在电子商务中有着决定的应用地位，话句话说，ERP是电子商务的重要组成部分，没有ERP，电子商务的的出现会推迟好几年;没有ERP，电子商务的产品管理、材料管理以及结构管理均会受到发展阻力，总之ERP在电子商务中的应用起着举足轻重的作用，它是电子商务的核心所在。具体来说，二者之间的存在着兼容、业务流互助积极应用互补三方面的关系，如下所示：
ERP在电子商务中应用体现
1.电子商务中供应链的兼容性
对应于企业的物流、资金流、和信息流存在着三条供应链，分别为：物资供应链流、资金供应链流和信息供应链流。由于电子商务 的存在，物流和资金流出现了新的现象，即网上采购和销售。尽管ERP使用供应链的管理思想早于电子商务，但供应链并不依赖于ERP的存在而存在，它可以存在于任何企业应用系统。因此，通过组织结构和业务流程重组，电子商务 也融入了供应链的思想。
2.电子商务业务流中的辅助作用
企业的整个业务流程都是在ERP 系统的管理下运行的，电子商务可以为ERP 提供辅助性的帮助，表现在为决策层的数据查询与分析提供帮助，为中间层的管理和控制提供帮助，为作业层的业务实现提供帮助。
电子商务与ERP互补
3.二者应用的互补性
ERP 侧重于内部管理，电子商务侧重于外部交流，两种模式同时存在，互相补充，共同起作用。
因此，电子商务和ERP有机结合，前者可以重点考虑网上采购、网上销售、资金支付等模块，把这些模块整合在一起，形成新的应用系统，提高企业运作效;后者则可以重点考虑采购、生产、销售、库存管理等物流和资金流模块，这样二者就可以实现各种资源的整合、规划和管理，不仅能够帮助企业推动ERP系统的实施，而且对电子商务中的各方市场的扩展也有极大的拓展作用，如采购市场、销售市场等，同时，还可以避免传统的ERP 存在着如缺乏前端与客户交互的程序的缺陷，在信息化加速发展的今天可极大地提升发展空间，实现同前端电子商务高度的信息集成。
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