协同办公中电子签章系统的应用十分广泛且深入，这从下面具体的协同办公模式的特征就可以看出来。
协同办公，是现代化办公中，政府、企业事业单位利用互联网信息技术，在组织内部通过建立统一通讯、信息交流、共享平台，实现文件管理、业务处理自动化的一种灵活、高效的电子化、信息化、集成化办公模式。协同办公中几乎所有的步骤都涉及了电子文件的签章审核、批准、确认的操作，比如在各种申请、报告、信息交换等各种工作中，都需要应用电子签章系统来进行签章确认审批。所以说，协同办公中电子签章系统的应用已经具有了一定的广度与深度，同时，随着信息技术的发展，电子签章系统的应用还在不断地拓展与加深。
协同办公中电子签章系统的应用具体方法：
在协同办公中，电子签章系统支持对各种形式与格式的电子文件的签章审批功能。比如Word、Excel等Office、Web、PDF、HTML等格式文件的电子签章；此外，电子签章系统还支持多人、多单位会签功能，能够实现协同办公中多部门的业务联合审批；同时电子签章系统支持全文批注、二维条码、授权控制、身份认证等验证技术，能够有效保证各种电子文件、数据信息的安全性、完整性、严密性、方篡改性、防抵赖性。
协同办公中电子签章系统的应用功能主要有：文件签章、文档保护、撤销签章、签章控制、签章验证、身份认证、文档锁定/解锁、二维条码生成、二维条码识别、签章日志管理、提供二次开发接口等功能。
在传统的签章模式当中，领导人直接在打印出来的文件、单据上手动签字盖章，耗费时间，也增加了纸张和打印成本。而协同办公中电子签章系统的应用，不仅避免了时间与物资的浪费，实现了无纸化办公，同时提高了工作效率，成为协同办公发展的必然趋势。