目前我国现有的MES系统除了在冶金、石化、机械等行业应用得较好外，大多只提供了一个替代经验管理方式的系统平台，没有建立面向产品设计与制造一体化的知识库支撑体系，使得在当前绿色制造背景下，如何高效地利用不可再生能源与生产设备资源。缺乏通过智能传感器、虚拟仿真、智能优化模型库等对千变万化的制造过程进行优化调控的手段。
因此，实现智能制造是我国MES系统发展的方向，所谓智能制造就是将人工智能融合进制造的各个环节，通过模拟专家的智能活动，取代或延伸制造环境中应由专家完成的那部分活动。但是毋庸置疑的是，MES软件产业正在逐步走向成熟：
第一：中国尚未形成完整的MES产业链，MES产业链包括：体系研究、软件开发、咨询、服务、评价等方面，其是一个整体，而目前这个产业链里面有断层，这个断层在哪儿？就是我们没有自己的体系研究，而是将国外的东西拿过来照抄、照搬，没有做到“拿来主义”，另外，这个行业的咨询服务能力还比较弱，ERP为何现在变得相对成熟，因为有一大批独立于软件的咨询公司在进行ERP项目的实施，而目前MES产业的这只力量很弱，大家谈论的更多的是功能，当哪一天这个产业除了谈论MES的功能之外，更多讨论的是IE（Industrial Engineering 工业工程），将是表示这个产业走向成熟的标志。第二：MES在企业的应用度还不高，企业对MES缺乏理性的理解，不少企业寄幻想通过实施MES来解决之前信息系统的遗留问题（如计划等）不切实际的想法，正如当年大家认为ERP能包治百病一样（当然这同有些供应商不负责任的宣传也有关系）。
第三：已经应用的MES系统中的企业，使用得更多的是实现了制造信息采集工作，但是制造数据整合还没有完全整合，应用深度有待提升；同时没有通过MES的实施，实现从制造执行、到计划决策的完整的闭环，制造过程并没有实现均衡化制造，优化也就变得空中楼阁了。
第四：MES软件厂商的集中度不高，还处于“逐鹿中原”的混战阶段，ERP流派、PLM流派、工控流派、独立MES流派、企业流派等百花齐放，各执一词，让企业陷入无限的概念沼泽中，不能自拔！
第五：相关的规范还未成熟，虽然MES在国际上有ISA-95 标准，但供应商更多的是将之作为其宣传的要点，但该标准体系如何与中国的企业实际相结合，如何与不同行业的特点相结合，相应的研究还比较少。
目前，MES在国内的应用难点有几个方面：其一，对MES项目的理解与定位的不准确与不清楚，比如有很多用户简单地将MES与“数据采集+数据展示”划上了等号，并不了解MES技术的真正用处；其二，现有用户管理体制的限制。建议用户在进行MES实施前，对MES要有充分的理解，要做充分贴切的需求分析与实事求是的建设规划，并对实施MES系统后对管理体制可能造成的影响进行评估与对应；选择成熟可靠的MES产品及有实力的供应商，适当的情况下可邀请一些有经验的MES厂商或咨询公司参与项目科研分析，共同进行项目建设规划。先进成熟的MES系统里往往集成了行业内生产管理的一些科学理念，因此从某方面讲，MES的实施是对用户生产管理体制一定程度的变革，有时，企业因为体制上的限制在接受这种管理理念变化时有阻力；其三，MES建设未做到要立足当前、着眼未来，往往存在重复性建设。
总之，中国的MES产业要走向成熟还有很长的路要走！