施工企业内部职责划分不利于信息化建设，设备管理系统信息化是施工企业信息化的一个重要组成部分，其发展必然受施工企业内部管理机制的影响。通常一个施工企业设备管理信息工作，从横向上分析，由多个部门来推进：设备管理部门、资产管理部门以及信息化管理部门。设备部门偏重于技术管理，资产管理部门偏重于账务管理，信息化管理部门负责信息化技术。在施工企业项目管理的操作层面，设备管理部门负责维护设备的技术性能，而设备消耗，如油料、配件等又主要由物资部门来管理。
而从纵向关系上分析，一个大型施工企业往往是多级法人的管理模式，如总公司、集团公司、三级公司等。因此施工企业的设备管理工作通常采用“统一领导，分级管理”的模式，即上一级公司负责制定相对宏观的管理制度和办法，并负责监督执行；下一级公司则进行具体的操作和管理。但由于以下几方面原因导致管理难度加大：①业务种类不同导致设备构成不同。如以土方施工为主的施工企业设备构成则以通用设备为主，其管理便于统一；若是以桥梁、隧道施工为主的施工企业，则设备的构成以专用设备或非标设备为主，则往往大型关键设备要单独制订办法进行管理。
②地域分布不同导致设备管理系统模式的差异。如子分公司处于东部经济较发达地区，则可利用的社会资源较多，则以租赁和服务外包方式管理为主，设备管理偏重于设备租赁费用的结算；处于西部经济欠发达或不发达地区，则以自有设备为主，管理也多依赖施工企业自己的力量，则更偏重于设备的全寿命管理。
③不同施工企业管理习惯的差异。比如有些单位将专用设备集中在某一子分公司进行管理，而有些单位则将专用设备分散在几个子分公司管理。这样不同类设备管理要求上的差异难以按照一个统一的操作流程进行管理。
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