目前，进销存软件与POS收银软件都是应用广泛的管理软件，有人因为进销存软件涉及到资金管理方面，因此将两者混淆，实际上以中小企业为目标客户的进销存软件和针对超市、连锁卖场应用的POS收银软件区别明显。
进销存软件主要是针对中小型企业的采购、销售、库存、应收应付账款、费用、报表等管理，特别是商贸企业、批发企业，使用得比较多，价格不是很贵，从几百元到几千元不等；此类型客户要求不是很高，管理也不是很复杂，软件操作也比较容易上手，实施周期短，投入少见效快。
进销存软件中颇具代表性的软件为乾元坤和进销存软件，该软件是对企业生产经营中进货、出货、批发销售、付款等进行全程跟踪管理，从接获订单合同开始，进入物料采购、入库、领用到产品完工入库、交货、回收货款、支付原材料款等，每一步都为用户提供详尽、准确的数据，有效辅助企业解决业务管理、分销管理、存货管理、营销计划的执行和监控、统计信息的收集等方面的业务问题，进销存软件在公司的经营销售管理中，涉及生产管理、产品库存管理、销售管理、资料档案、客户资源信用管理，资金收付、成本利润等方方面面。
POS收银软件是针对卖场、商场、超市、连锁类企业的管理软件，由于这类企业公司的经营方式和性质，决定了POS软件的主要重点在于收银管理、会员管理、和各类商品促销管理。对于进销存和财务功能，相对弱化。一般来说，对于小超市，使用单独的单机版收银软件也足够了；而对于大卖场或者大型连锁，还得涉及到配送等环节，同时还需要配合其他财务软件一起使用。
尽管进销存软件和POS收银软件都关系到货品以及资金的流向管控，但是从目标客户、功能设置等，存在明显的区别度。因此，企业在进行管理软件选型时需了解清楚再做决定。