财务管理软件与税务会计软件看似两者均与资金管理有关，因此常常有人将二者混淆，以为只是名称上的不同而已，软件的具体功能相当。实际上，财务管理软件与税务会计软件侧重点不同，二者同为资金管理软件，但存在迥然区别。
企业税务会计软件是采用四流合一的理念设计，在企业经营活动的全过程中产生并记录其税务关系数据，在税务法律法规政策的指导下，做出规范的税务报表，同时采用这些报表数据指导财务账务的制作的财务管理软件，和一般的财务管理软件不同，它更利于指导企业经营活动。
从两者功能上来说，财务管理软件主要功能模块包括总账管理系统、工资管理系统、固定资产管理系统、成本管理系统、应收应付管理系统等，而在各系统业务都会涉及到税务，税务流已经伴随着资金流成共生态势，企业税务会计软件所需要的数据都可以从财务软件各系统中获得并进行相应的核算。
从纳税调整角度来说，财务与税务分离的趋势越来越明显，企业税务关系越来越重要。企业税务会计管理软件采用四流合一的理念设计，在企业经营活动的全过程中产生并记录其税务关系数据，在税务法律法规政策的指导下，做出规范的税务报表，同时采用这些报表数据指导财务账务的制作，更利于指导企业经营活动。
财务管理软件中，表现突出的当属乾元坤和财务管理软件。乾元坤和财务管理软件的开发、设计是以先进的财务管理思想为基础，整合财务会计、管理会计、成本会计于一体，有利于财务做前瞻性分析与预测，体现了先进的计划、控制和决策思想。
该财务管理软件支持多用户操作和多套帐管理，依据财务人员的工作性质和企业的管理特点系统内设账务管理、进销存管理、固定资产管理、工资管理等独立系统，每个系统既独立运行，又相互关联，缺一不可，共同组成一个完整的财务系统。